En el cariotipo los cromosomas se ordenan por tamaño y posicion del centromero

El cariotipo humano se hace generalmente mediante microfotografías. Los cromosomas se recortan y se disponen con sus pares respectivos en una serie decreciente de tamaño . La técnica se facilita si se determina el llamado "índice centromerico" , que representa la relación entre la longitud del brazo largo y corto del cromosoma .
 
Recientemente se introdujo un sistema de computación adaptado al microscopio , que permite hacer un "barrido" para localizar las metafases , contar los cromosomas y transmitir las imágenes en un computador . Todas estas etapas ayudan en la obtención mas rápida del cariotipo.

En la siguiente imagen se muestra la clasificación para los cromosomas del cariotipo humano .